Trong một lần đi chơi với đội thám tử nhí và tiến sĩ Agasa tại Trung tâm mua sắm Beika, Conan vô tình thấy dấu vết của tổ chức áo đen. Cậu bí mật hành động mà không cho Haibara Ai biết. Cậu bị bắn khi …
Trong một lần đi chơi với đội thám tử nhí và tiến sĩ Agasa tại Trung tâm mua sắm Beika, Conan vô tình thấy dấu vết của tổ chức áo đen. Cậu bí mật hành động mà không cho Haibara Ai biết. Cậu bị bắn khi vô tình vướng vào xích mích giữa bọn áo đen và con mồi của chúng, đồng nghĩa với việc cậu lại lần nữa mất dấu tổ chức...
Cùng ngày, Kuroba Kaito đến Trung tâm mua sắm Beika với Aoko và Akako. Cô nàng phù thủy Akako luôn tìm cách phá rối, không cho Aoko cùng Kaito có không gian riêng nên đã sử dụng sức mạnh từ các câu thần chú cổ. Nhưng bỗng nhiên anh chàng thám tử Hakuba Saguru xuất hiện khiến cô bị phân tâm, đọc sai câu thần chú khiến Kaito bất tỉnh...
Kaito và Conan cùng được chuyển vào Bệnh viện trung ương Beika...
Khi tỉnh lại, Siêu đạo chích cuối cùng của thế kỉ biến thành một chàng thám tử, Vị cứu tinh của cảnh sát Nhật Bản lại trở thành đạo tặc...